Linux / win98 ongelma

Homma lähti näin:
Hain Knoppix linuxista cd:ltä ajettavan kokeiluversion, ja kokeilun jälkeen päätin asentaa linuxin kovaleylle. Koneessani on 3 kovoa, 20gb maxtor (missä win98), 30gb maxtor (johon linux) sekä vielä 120gb maxtori..
Linux siis asentui hyvin tuolle maxtorin 30gigaiselle ja pyöri mukavasti, mutta bootin jälkeen ja windowsiin mennessä huomasin, että siellähän on vain yksi kovalevy (se missä itse windows sijaitsee)
Sain jollain konstilla se maxtorin 30gb näkymään, mutta ilman tiedostotyyppiä, joten se piti formatoida, jolloin lähti linux.
Linux kuitenkin asensi c:lle minnelie käynnistyslataajan (Lilo) joka nyt aukeaa joka bootin yhteydessä. Auttaako joku muu kuin windowsin uudelleenasentaminen, ja miten se käy käytännössä? formatoinko c:n ja kun kone sanoo käynnistyksessä jotain: käyttöjärjestelmä puuttuu, niin isken win98 cd:n sisään? jos tämä auttaisi saamaan sen 120gb kovon takaisin ilman että arvokasta dataa häviää
Muuten, kun sitä linuxia ajaa tässä vaiheessa rompulta, se kyllä näyttää kaikki kovalevyt oikein, ja ohjelmia voi ajaa sieltä.. kummallista
toivottavasti ymmärsitte/saitte selvää tekstistä, ja kiitos kaikille etukäteen vastauksista

edit: typot